Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx17Q8BVL3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms