Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tspan12Q8BKT6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tspan12Q8BKT6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms