Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf144bQ8BKD6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf144bQ8BKD6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf144bQ8BKD6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rnf144bQ8BKD6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf144bQ8BKD6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rnf144bQ8BKD6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf144bQ8BKD6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144bQ8BKD6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144bQ8BKD6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144bQ8BKD6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf144bQ8BKD6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144bQ8BKD6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144bQ8BKD6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144bQ8BKD6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144bQ8BKD6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf144bQ8BKD6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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