Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q8BGC1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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