Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lrfn4Q80XU8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lrfn4Q80XU8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lrfn4Q80XU8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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