Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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NipblQ6KCD5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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