Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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