Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcn1Q64347 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms