Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ccdc18Q640L5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ccdc18Q640L5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Ccdc18Q640L5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Ccdc18Q640L5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Ccdc18Q640L5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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