Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms