Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx49Q4FZF3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddx49Q4FZF3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ddx49Q4FZF3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ddx49Q4FZF3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ddx49Q4FZF3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx49Q4FZF3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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