Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms