Protein–RNA interactions for Protein: Q3V185

BC147527, Similar to 2-cell-stage, variable group, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC147527Q3V185 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC147527Q3V185 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms