Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms