Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ttc9Q3V038 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ttc9Q3V038 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ttc9Q3V038 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ttc9Q3V038 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ttc9Q3V038 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ttc9Q3V038 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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