Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm648Q3UJ22 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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