Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx27Q3UHD6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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