Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms