Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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