Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms