Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cul4aQ3TCH7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms