Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms