Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms