Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms