Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pate4Q09098 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pate4Q09098 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms