Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AmbpQ07456 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1040.9 ms