Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cntn3Q07409 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cntn3Q07409 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms