Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms