Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms