Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pde1bQ01065 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms