Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb2Q00977 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb2Q00977 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms