Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoa1Q00623 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms