Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms