Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hoxd13P70217 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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