Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms