Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PlnP61014 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PlnP61014 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms