Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sh3bp1P55194 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sh3bp1P55194 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sh3bp1P55194 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sh3bp1P55194 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sh3bp1P55194 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sh3bp1P55194 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sh3bp1P55194 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sh3bp1P55194 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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