Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hoxc13P50207 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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