Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp9P49962 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp9P49962 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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