Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rfx2P48379 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms