Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rfx1P48377 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rfx1P48377 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rfx1P48377 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rfx1P48377 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rfx1P48377 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rfx1P48377 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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