Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms