Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TtlP38585 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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TtlP38585 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TtlP38585 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TtlP38585 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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TtlP38585 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TtlP38585 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TtlP38585 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TtlP38585 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TtlP38585 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TtlP38585 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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