Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RxraP28700 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RxraP28700 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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