Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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