Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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