Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnnc1P19123 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms