Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P18528 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P18528 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P18528 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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