Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
DmdP11531 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
DmdP11531 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms