Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms